Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF8Q9UPP1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms