Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CGGBP1Q9UFW8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CGGBP1Q9UFW8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms