Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms