Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD5Q9P267 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms