Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RDH8Q9NYR8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms