Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCC13Q9NSE7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCC13Q9NSE7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCC13Q9NSE7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms