Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHACTR1Q9C0D0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms