Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms