Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIOK2Q9BVS4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms