Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5RAP3Q96JB5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms