Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTV1Q96GA3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms