Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms