Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN23Q96B33 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms