Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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