Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR53Q7Z5U6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms