Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBA3EQ6PEY2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms