Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP170Q5SW79 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms