Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD4L6Q3SYB3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD4L6Q3SYB3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms