Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms