Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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