Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms