Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNAB1Q14722 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNAB1Q14722 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms