Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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