Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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CLN3Q13286 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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CLN3Q13286 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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CLN3Q13286 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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CLN3Q13286 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLN3Q13286 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLN3Q13286 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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