Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA3Q08378 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms