Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms