Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms