Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GCNT1Q02742 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms