Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HK3P52790 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HK3P52790 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HK3P52790 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms