Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms