Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYKP34925 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYKP34925 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYKP34925 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RYKP34925 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms