Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms