Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms