Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms