Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRHP20396 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRHP20396 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRHP20396 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRHP20396 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms