Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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