Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms