Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEFLP07196 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms