Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POP4O95707 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POP4O95707 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POP4O95707 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POP4O95707 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POP4O95707 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POP4O95707 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms