Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLGNO14967 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLGNO14967 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms