Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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