Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MAP3K4Q9Y6R4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms