Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AURKCQ9UQB9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms