Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REREQ9P2R6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REREQ9P2R6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms