Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAPAQ9P0L0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms