Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TMEM27Q9HBJ8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM27Q9HBJ8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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