Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZCCHC2Q9C0B9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms