Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ROPN1BQ9BZX4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ROPN1BQ9BZX4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms