Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF17Q9BXT8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms