Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL25A1Q9BXS0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms